DIA蛋白組學(xué)是利用DIA技術(shù)（如SWATH）研究蛋白組，iTRAQ蛋白組學(xué)是利用iTRAQ技術(shù)研究蛋白組。百泰派克生物科技提供iTRAQ蛋白組學(xué)分析服務(wù)。

DIA蛋白組學(xué)

DIA是一種質(zhì)譜采集技術(shù)，DIA蛋白組學(xué)是指利用數(shù)據(jù)非依賴采集（data-independent acquisition，DIA）技術(shù)研究蛋白質(zhì)組。在DIA模式下，對于每個循環(huán)，儀器都將聚焦在狹窄的母離子質(zhì)量窗口上，并從該窗口內(nèi)檢測到的所有母離子中獲取MS / MS數(shù)據(jù)。然后，此質(zhì)量窗口跨越整個質(zhì)量范圍，系統(tǒng)地從每個質(zhì)量和所有檢測到的母離子中收集MS / MS數(shù)據(jù)。即不預(yù)先對母離子進(jìn)行篩選，以獲得所有離子的碎片信息。DIA中最常見的一種方法為SWATH。SWATH技術(shù)可以不用進(jìn)行樣品的標(biāo)記而對樣品蛋白進(jìn)行定量，能夠?qū)?fù)雜樣品中幾乎所有可檢測的分子進(jìn)行定量測定。

iTRAQ蛋白組學(xué)

iTRAQ蛋白組學(xué)是指利用iTRAQ（isobaric tag for relative and absolute quantitation）技術(shù)研究蛋白質(zhì)組，iTRAQ是一種數(shù)據(jù)依賴采集（data-dependent acquisition，DDA）的質(zhì)譜采集技術(shù)。在iTRAQ中，需要用iTRAQ試劑對樣品進(jìn)行差異標(biāo)記，不同樣品的同一肽段在一級質(zhì)譜中質(zhì)譜峰相同，選定對應(yīng)質(zhì)譜峰進(jìn)行碎裂，在二級質(zhì)譜中不同樣品的同一肽段因標(biāo)記時報告基團(tuán)不同而可以區(qū)分開，通過它們的質(zhì)譜峰信號強(qiáng)弱即可進(jìn)行定量。iTRAQ蛋白組學(xué)可在一次實驗時同時比較多種樣品中的蛋白質(zhì)的相對和絕對含量。

DIA蛋白組學(xué)和iTRAQ蛋白組學(xué)比較

相對于iTRAQ，DIA不會造成低豐度蛋白信息的丟失，定量準(zhǔn)確度較高，數(shù)據(jù)可重現(xiàn)性較高，但無法直觀的看到二級質(zhì)譜圖中的碎片來自哪一個母離子。而iTRAQ可以直接看到二級質(zhì)譜圖中的碎片來自哪一個母離子，且可以同時分析多個樣品。在實驗時，研究者可以根據(jù)自己的實際情況進(jìn)行選擇。